细胞为了维持内环境稳定,清除正常的衰老细胞和有害的细胞,或为了确保正常的生长发育,受基因调控会发生自主地有序地死亡。
这种方式称为细胞凋亡(Apoptosis),也称为程序性细胞死亡(Programmed cell death,PCD)。
那么细菌是否也会发生凋亡呢?
乍一想,凋亡作为机体生存进化的一个生物学事件,细菌面临着生老病死,应该也存在凋亡吧。
但是,德国微生物学家Georg 于2013年发表了一篇文章[1],提出了这样的观点:
虽然细菌死亡和细胞死亡有相同的生物学表现,如PS外翻、核固缩、DNA断裂,但是也可能存在其他的特征。
普遍认同的机体防御和MazEF毒素-抗毒素自杀调节机制这两种细菌凋亡的途径,目前仍缺乏充足的实验支持,不能说明细菌发生细胞凋亡的特征就是细菌凋亡引起的,或许是细菌碰巧发生了这种阳性结果。
因此,在细菌死亡的目的和机制还没得到明确之前,不建议用细胞凋亡的术语来描述细菌的死亡。
随后,2014年,Kenneth教授发表在Nat Rev Microbiol杂志上的综述[2],表明利用能够诱导Jurkat白血病细胞凋亡的人乳脂质-蛋白质复合物(又称为HAMLET)处理肺炎链球菌,观察到了如细胞收缩、钙依赖性膜电位去极化、染色质凝聚、DNA断裂等凋亡表征。
更有趣的是,肺炎链球菌的膜去极化动力学与线粒体相似,两者都受到Ca2+转运抑制剂的抑制。同时HAMLEF也可诱导其他链球菌和流感嗜血杆菌细胞死亡[3-5]。
用DNA损伤剂和抗菌素处理大肠杆菌,也会产生凋亡的表征。删除RecA基因会减轻凋亡的程度,而且令人兴奋的是,用DNA损伤剂和抗生素治疗会产生一种与Caspase荧光底物FITC-z-vd-FMK相互作用的蛋白质RecA。提示ClpXP蛋白酶复合物参与了这一活性,猜想recA能够诱导细菌凋亡[6-7]。
在E.coli细菌中,MazEF系统和RecA基因调控的SOS应答系统参与了PCD进程[8-9]。
总之,Kemmeth教授认为,细菌细胞死亡是一个活跃的、遗传编码的、高度协调的过程,与死前和死后事件有关,而且与真核细胞中的PCD过程惊人地相似。
因此,小编认为,用诱导细胞凋亡的方式诱导细菌死亡,这种方式可以称为细菌凋亡,不过细菌中有关PCD相关蛋白的调节和功能研究仍需进一步探索。
图片来源 | 参考文献[2]
图例 | 细菌PCD模式通路。经紫外诱导的健康的细菌细胞,由毒素-抗毒素TA系统(如MazEF)和SOS应答系统调控的死亡过程。
另外Kim教授也认为[10],细菌存在凋亡样的死亡,有助于细菌生长发育和遗传物质交换,清除有缺陷的细胞,减少突变体的负荷,并导致群体死亡,进一步研究其机制可为新型抗菌药物的研发提供新的思路。
细菌的凋亡表型中,初期的典型特征是细胞膜PS外翻,如果用Annexin V/PI检测细菌凋亡,和细胞的检测有哪些区别呢?
因为细菌有细胞壁,所以第一步需要用溶菌酶破碎细菌细胞壁,文献里用终浓度100mg/L的溶菌酶和细菌沉淀在37℃水浴条件下孵育1h,其余的操作与细胞的操作类似。
而且发现,饥饿处理的苍白杆菌若没有经细胞壁处理,用3个不同梯度的Annexin V(分别是100μg/L, 200μg/L, 300μg/L)(A-C)染色,结果均检测不到PS,而用溶菌酶处理后,分别取调整期、对数期、平台期和衰亡期细菌检测(D-G),均可看到较明显的Annexin V的表达[11]。如下图所示:
图例 | 说明饥饿处理的苍白杆菌经溶菌酶处理后(D-G),跟未经溶菌酶处理组(A-C)相比,可以用Annexin V检测到细菌凋亡外翻的PS。CT指细菌培养时间。
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参考文献:
[1] Georg Häcker. Is there, and should there be, apoptosis in bacteria? Microbes Infect. Jul-Aug 2013; 15(8-9): 640-4.
[2] Kenneth W Bayles. Bacterial programmed cell death: making sense of a paradox. Nat Rev Microbiol. 2014 Jan; 12(1): 63-9.
[3] Hakansson AP, Roche-Hakansson H, Mossberg AK,etal. Apoptosis-like death in bacteria induced by HAMLET, a human milk lipid-protein complex. PLoS One. 2011; 6: e17717
[4] Hakansson A, Zhivotovsky B, Orrenius S, etal. Apoptosis induced by a human milk protein. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1995; 92: 8064–8068.
[5] Svensson M, Hakansson A, Mossberg AK, etal. Conversion of alpha-lactalbumin to a protein inducing apoptosis. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2000; 97: 4221–4226.
[6] Dwyer DJ, Camacho DM, Kohanski MA, etal. Antibiotic-induced bacterial cell death exhibits physiological and biochemical hallmarks of apoptosis. Mol Cell. 2012; 46: 561–572.
[7] Daniel J Dwyer, Diogo M Camacho, Michael A Kohanski, etal. Antibiotic-induced bacterial cell death exhibits physiological and biochemical hallmarks of apoptosis. Mol Cell. 2012 Jun8; 46(5): 561-72.
[8] Da Rocha RP, Paquola AC, Marques Mdo V, etal. Characterization of the SOS regulon of Caulobacter crescentus. Journal of bacteriology. 2008; 190: 1209–1218.
[9] Erental A, Sharon I, Engelberg-Kulka H. Two programmed cell death systems in Escherichia coli: an apoptotic-like death is inhibited by the mazEF-mediated death pathway. PLoS Biol. 2012; 10: e1001281.
[10] K Lewis. Programmed death in bacteria.Microbiol Mol Biol Rev. 2000 Sep;64(3):503-14. doi: 10.1128/mmbr.64.3.503-514.2000.
[11] Ben Chen, Yasi Zhao, Zemin Li, Jianxin Pan ,etal. Immobilization of Phosphatidylserine by Ethanol and Lysozyme on the Cell Surface for Evaluation of Apoptosis-Like Decay in Activated-Sludge Bacteria. Appl Environ Microbiol. 2020 Jul 2; 86(14):e00345-20.